Program KOMA posiada mechanizmy pozwalające na porównywanie dwóch kosztorysów. Oczywiście ma to sens tylko wtedy, gdy kosztorysy te są ze sobą „blisko spokrewnione„. Zasadniczo mechanizm ten można wykorzystać w jednym z trzech celów:
1. Sprawdzenie zgodności kosztorysu z danymi katalogowymi. Sprawdzany kosztorys porównuje się z drugim, który został automatycznie utworzony przez program z wykorzystaniem oryginalnej bazy katalogowej – funkcja Sprawdź kosztorys.
2. Porównanie dwóch wersji (starszej i nowszej) jednego kosztorysu, aby znaleźć i ewentualnie skorygować różnice – funkcja Porównanie kosztorysów.
3. Porównanie ze sobą kosztorysów od różnych oferentów – funkcja Porównanie kosztorysów.
Porównaniu podlegają takie elementy jak opis pozycji oraz jej wartość, opis, norma, cena i wartość elementu RMS, opis i wartość działu, elementy narzutu. Oba porównywane kosztorysy widoczne są równocześnie na ekranie jako sąsiadujące w pionie lub w poziomie.
Różnice między kosztorysami uwidaczniane są na ekranie za pomocą zmiany koloru tła lub czcionki. Strzałki Poprzednia różnica i Następna różnica pozwalają na szybkie wyszukiwanie różnic między porównywanymi kosztorysami.
Jednocześnie w panelu obok Spisu pozycji pojawia się panel Spis różnic.